機械学習によるタンパク質N-ミリストイル化規則の予測

Machine learning prediction of Amino acid sequence characterization in Protein N-Myristoylation

Creators Okada Ryo

Creators Sugii Manabu

Creators Matsuno Hiroshi

Creators Miyano Satoru

タンパク質N-ミリストイル化は、真核生物及び、ウイルス由来のタンパク質のN末端に炭素数14の飽和脂肪酸であるミリスチン酸が共有結合するタンパク質の脂質修飾である。本研究では機械学習システムBONSAIを用いて、タンパク質N-ミリストイル化に対する配列要求を調べた。BONSAIは、インデキシングと決定木の形で規則を発見する。実験の結果、BONSAIはミリストイル化に影響すると考えられているアミノ酸をインデキシングした。さらにミリストイル化を誘導する配列に関して、従来より重要とされてきた位置に加え、新たに、関係ないとされていた位置についてのアミノ酸要求の可能性も示唆した。

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[ISSN]0919-6072

[NCID]AA12055912

[isVersionOf] [NAID]http://ci.nii.ac.jp/naid/110003482751/