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CAPS marker screening of the illusive Kunenbo : a Mandarin orange from Yamaguchi

Bulletin of Yamaguchi Science Research Center Volume 2 Page 1-9
published_at 2022-03-01
山口学研究2-001.pdf
[fulltext] 687 KB
Title
CAPSマーカーを用いた山口県の幻のミカン クネンボ(九年母)の探索
CAPS marker screening of the illusive Kunenbo : a Mandarin orange from Yamaguchi
Abstract
農産物の多くは、その時代にあった新しい品種に置き換えられ栽培が行われてきた。その一つにカンキツがあり、現在、国内で最も栽培されているカンキツ品種はウンシュウであるが、明治初期にはミカン(蜜柑)、コウジ(柑子)に次いでクネンボ(九年母)が多く、クネンボの生産額は山口県が全国一であった。しかし、今ではクネンボ(Citrus nobilis varkunep)の名前を知る人もほとんどいない幻のミカンとなり、県内でクネンボの樹があるのかさえ分かっていない。このカンキツは、江戸から明治期の食文化を考える上で重要な農産物でもあり、当時の長州と英国との異文化交流などを知ることができる貴重な食材の一つなっている。クネンボを地域の資源として現代に復元させるために、県内の品種不明のカンキツからクネンボのスクリーニングを行った。天保期の長州藩の地誌『防長風土注進案』に記載されたカンキツの地理情報や史料、気象条件などからクネンボの探索地域を3 か所に絞り込み、次いでDNAマーカーであるCAPS(Cleaved Amplified PolymeraseSequence)を用いて農研機構(国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構)で保存されているクネンボ(NIAS Genebank, JP 117387)と県内に自生している品種不明カンキツのゲノムDNA の多型を比較することでクネンボの探索を行った。品種同定のために既存のカンキツ112 種を識別できる7 種のCAPS からなる最少マーカーセットを選抜し、次いでアレルの組合せが多様な交雑種からでもクネンボを識別させるために5CAPS を加えたマーカーセットを使用した。しかしながら、採取したすべてのサンプルにおいてクネンボを見出すことはできなかった。特に萩地域では、品種不明のカンキツの多くが小型のナツダイダイであり、長州藩家臣の屋敷跡地や植栽図で200 年以内に確実にクネンボが植えられていた園庭であっても、クネンボを見出すことはできなかった。一方、宗像大社の祭事で用いられてきたクネンボは、農研機構と同じ遺伝子型を示した。これらの結果は、ゲノムサイエンスにより、今まで曖昧であった地域の農産物などの品種を特定すると共に、かつてはその地域を代表する農産物でありながら現在では入手困難な農産物であっても、DNA 多型を調べることで「埋もれた地域資源」を掘り起こし、復活させることができることを示唆していた。
Creators Shibata Masaru
Affiliate Master Yamaguchi University
[kakenhi]15501 grid.268397.1
Creators Higuchi Naoki
Creators Motomizu Arito
Creators Okazaki Yoshio
Creators Nishioka Mari
Creators Goto Yoshiko
Affiliate Master Yamaguchi University
[kakenhi]15501 grid.268397.1
Source Identifiers
Languages jpn
Resource Type departmental bulletin paper
Publishers 山口大学山口学研究センター
Date Issued 2022-03-01
File Version Version of Record
Access Rights open access
Funding Refs
Yamaguchi University [crossref_funder]https://doi.org/10.13039/100016983
Award 山口・食の温故知新 ~長州食材・料理を復活し新たな価値を見出す~ [Crossref Funder] https://doi.org/10.13039/100016983 山口学研究プロジェクト2019年度採択プロジェクト(1)
Funding Refs
ASAHI GROUP FOUNDATION
Award 幕末における日英饗応料理からみる食文化の変遷 生活文化部門第34回(平成31年)