Sugii Manabu
Affiliate Master
Yamaguchi University
Machine learning prediction of Amino acid sequence characterization in Protein N-Myristoylation
IPSJ SIG technical reports Volume 2005 Issue 128
Page 1-6
published_at 2005-12
Title
機械学習によるタンパク質N-ミリストイル化規則の予測
Machine learning prediction of Amino acid sequence characterization in Protein N-Myristoylation
タンパク質N-ミリストイル化は、真核生物及び、ウイルス由来のタンパク質のN末端に炭素数14の飽和脂肪酸であるミリスチン酸が共有結合するタンパク質の脂質修飾である。本研究では機械学習システムBONSAIを用いて、タンパク質N-ミリストイル化に対する配列要求を調べた。BONSAIは、インデキシングと決定木の形で規則を発見する。実験の結果、BONSAIはミリストイル化に影響すると考えられているアミノ酸をインデキシングした。さらにミリストイル化を誘導する配列に関して、従来より重要とされてきた位置に加え、新たに、関係ないとされていた位置についてのアミノ酸要求の可能性も示唆した。
Languages
jpn
Resource Type
journal article
Publishers
情報処理学会
Date Issued
2005-12
Rights
本著作物の著作権は（社）情報処理学会に帰属します。本著作物は著作権者である情報処理学会の許可のもとに掲載するものです。ご利用に当たっては「著作権法」ならびに「情報処理学会倫理綱領」に従うことをお願いいたします。()
File Version
Version of Record
Access Rights
open access
Relations
[ISSN]0919-6072
[NCID]AA12055912
[isVersionOf]
[NAID]http://ci.nii.ac.jp/naid/110003482751/