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フルテキストURL2007020134.pdf ( 336.0KB ) 公開日 2010-04-16
タイトルPerformance Improvement in Protein N-Myristoyl Classification by BONSAI with Insignificant Indexing Symbol
作成者Sugii, Manabu
Okada, Ryo
Matsuno, Hiroshi
Miyano, Satoru
作成者ヨミスギイ, マナブ
オカダ, リョウ
マツノ, ヒロシ
ミヤノ, サトル
作成者別表記杉井, 学
松野, 浩嗣
宮野, 悟
作成者所属山口大学大学情報機構
山口大学大学院理工学研究科(工学)
内容記述(抄録等)Many N-myristoylated proteins play key roles in regulating cellular structure and function. In the previous study, we have applied the machine learning system BONSAI to predict patterns based on which positive and negative examples could be classified. Although BONSAI has helped establish 2 interesting rules regarding the requirements for N-myristoylation, the accuracy rates of these rules are not satisfactory. This paper suggests an enhancement of BONSAI by introducing an ”insignificant indexing symbol” and demonstrates the efficiency of this enhancement by showing an improvement in the accuracy rates. We further examine the performance of this enhanced BONSAI by comparing the results of classification obtained the proposed method and an existing public method for the same sets of positive and negaitve examples.
本文言語eng
著者キーワードN-myristoylation
machine learning
alphabet indexing
protein classification
資料タイプtext
ファイル形式application/pdf
出版者日本バイオインフォマティクス学会
出版者ヨミニホン バイオインフォマティクス ガッカイ
NII資料タイプ学術雑誌論文
ISSN0919-9454
掲載誌名Genome informatics
18
1
開始ページ277
終了ページ286
発行日2007
PubMed IDinfo:pmid/18546495
関連情報URL(IsPartOf)http://www.jsbi.org/journal1/
著者版/出版社版出版社版
リポジトリID2007020134
地域区分山口大学
URIhttp://www.lib.yamaguchi-u.ac.jp/yunoca/handle/2007020134